Як нарахувати штрафні санкції при порушення строків виконання робіт генпідрядником?

Підкажіть будь-ласка, якщо Генпідрядник при виконанні робіт по капітальному ремонту допустив порушення сроків виконання робіт більш ніж на 30 днів. В Договорі зазначено: 13.1. Відповідальність Сторін за порушення зобов’язань Договору та порядок урегулювання спорів визначаються нормативними документами, що регулюють ці питання та цим Договором.
13.2. У разі невиконання або несвоєчасного виконання зобов’язань Генпідрядник сплачує Замовнику штрафні санкції (пеню) у розмірі облікової ставки НБУ за кожний день прострочки, а у разі здійснення попередньої оплати Генпідрядник, крім сплати штрафних санкцій, повертає Замовнику неосвоєні вчасно кошти з урахуванням індексу інфляції. Крім сплати штрафних санкцій Генпідрядник компенсує Замовнику збитки, зумовлені невиконанням або неналежним виконанням своїх зобов’язань за Договором.
Господарським Кодексом України передбачено: У разі якщо порушено господарське зобов’язання, в якому хоча б одна сторона є суб’єктом господарювання, що належить до державного сектора економіки, або порушення пов’язане з виконанням державного контракту, або виконання зобов’язання фінансується за рахунок Державного бюджету України чи за рахунок державного кредиту, штрафні санкції застосовуються, якщо інше не передбачено законом чи договором, у таких розмірах: за порушення строків виконання зобов’язання стягується пеня у розмірі 0,1 відсотка вартості товарів (робіт, послуг), з яких допущено прострочення виконання за кожний день прострочення, а за прострочення понад тридцять днів додатково стягується штраф у розмірі семи відсотків вказаної вартості.
Штрафні санкції за порушення грошових зобов’язань встановлюються у відсотках, розмір яких визначається обліковою ставкою Національного банку України, за увесь час користування чужими коштами, якщо інший розмір відсотків не передбачено законом або договором.
Чим в такому випадку керуватись при нарахуванні штрафних санкцій? З якої суми нараховувати штрафні санкції, якщо Генпідрядником було надано проміжний акт на фактично виконані роботи, але термін на виконання робіт закінчився 30 днів до того.